Doctorado en Ciencias Biológicas

Los gradientes altitudinales son variaciones ambientales fundamentales para la ecología y la biogeografía, permitiendo el estudio de cómo los factores abióticos y bióticos afectan a la distribución y estructura de las comunidades biológicas. En la Amazonía, donde el clima tropical y la extraordinaria biodiversidad crean un entorno complejo, estos gradientes interactúan con la estratificación vertical del bosque, moldeando de manera determinante la diversidad de especies. Las ranas de la familia Strabomantidae, endémicas de las Américas y adaptadas a diversas altitudes, son un modelo ideal para investigar estos efectos. Aunque Perú alberga muchas de estas especies, faltan estudios integrales sobre cómo los gradientes altitudinales impactan sus comunidades. El proyecto plantea investigar cómo los gradientes altitudinales afectan la estructura de comunidades de anuros Strabomantidae en la Amazonía peruana desde una perspectiva biogeográfica histórica. Se evaluará la diversidad alfa y beta de comunidades a lo largo de un gradiente altitudinal y se determinará cómo los eventos históricos han influido en la estructura de estas comunidades. La metodología incluye la recolección de datos en tres localidades de muestreo en los departamentos de San Martín y Huánuco, con transectos a diferentes altitudes. Los análisis moleculares se realizarán en colaboración con laboratorios en Perú y Francia, utilizando técnicas de secuenciación de ADN mitocondrial para reconstruir una filogenia de base e identificar clados principales. El estudio aprovechará datos de COI y 16S utilizados en publicaciones anteriores para explorar las interrelaciones de Strabomantidae y guiar el muestreo taxonómico para una mayor secuenciación del mitogenoma. Además, se ampliará la biblioteca de referencia con nuevas secuencias. La secuenciación se realizará mediante la Reacción en Cadena de Polimerasa (PCR) y se construirán árboles filogenéticos para estudiar la evolución y biogeografía en respuesta a los gradientes altitudinales. Se calculará la divergencia de secuencias utilizando el modelo Kimura 2-parámetros (K2P) y se construirá un árbol de neighbor-joining (NJ) para visualizar la divergencia entre especies. Para la delimitación de Unidades Taxonómicas Operativas (OTU), se utilizarán métodos basados en secuencias como Refined Single Linkage (RESL) y Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD). Se establecerá un esquema final de delimitación de OTU basado en un consenso entre los métodos utilizados. La reconstrucción filogenética se basará en la secuenciación de ADN de las especies muestreadas y en secuencias adicionales obtenidas de bases de datos. Se emplearán métodos de máxima verosimilitud o bayesianos para construir la filogenia y se integrarán con filogenias existentes mediante técnicas de superárboles. El análisis de la estructura filogenética de la comunidad implicará el cálculo de métricas de diversidad filogenética y la evaluación del grado de agrupamiento o dispersión filogenética en la comunidad. Se implementarán modelos nulos generando comunidades aleatorias y comparando la estructura filogenética observada con las expectativas del modelo. Se evaluará la señal filogenética en los rasgos ecológicos y se realizarán pruebas para rasgos clave. La interpretación y síntesis integrarán los resultados para comprender cómo la historia evolutiva ha influido en la estructura de la comunidad actual de Strabomantidae, discutiendo las implicaciones para la conservación y manejo de estas comunidades de anfibios.

RIOS ALVA ,EHIKO JERELHIN