Doctorado en Ciencias de la Salud

La resistencia a los antimicrobianos (RAM) es un problema de salud pública mundial que se ha incrementado debido al uso inadecuado de los antibióticos en la medicina humana, medicina veterinaria y la industria de la producción animal. La Organización Mundial de la Salud ha incluido a las enterobacterias resistentes a los carbapenémicos y productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) dentro de su lista de patógenos prioridad crítica debido a que están asociadas con perfiles multidrogo-resistentes, elevada carga sanitaria, alta tasa de mortalidad, y el incremento y diseminación de la RAM. El objetivo de este proyecto de tesis doctoral es realizar la evaluación genómica de la RAM en enterobacterias de prioridad crítica provenientes de la interfaz humano-animal medioambiente en el noreste de la Amazonía Peruana, mediante técnicas microbiológicas, moleculares y genómicas. Se colectarán muestras fecales de personas, animales domésticos y silvestres, así como muestras ambientales de aguas contaminadas con residuos humanos para aislar enterobacterias mediante técnicas microbiológicas convencionales. También se emplearán aislados de enterobacterias de muestras humanas y de animales criopreservadas en biobancos en los centros médicos y de investigación de la región. Todos los aislados serán evaluados mediante el método de difusión en disco de Kirby-Bauer para determinar sus perfiles fenotípicos de resistencia a los antimicrobianos, de acuerdo con los lineamientos del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Además, aquellos aislados que manifiesten resistencia a cefalosporinas de tercera generación y a carbapenémicos serán evaluados mediante el método de Jarlier, para confirmar la producción de BLEE, y el método de inactivación de carbapenémicos modificado (mCIM), para determinar la producción de carbapenemasas. Los aislados productores de BLEE y de carbapenemasas serán seleccionados para la secuenciación de sus genomas completos mediante la plataforma Illumina Miseq y Nanopore MinION. Los genomas obtenidos serán analizados para identificar el tipo de secuencia (ST), serotipo, filogrupo y todos los determinantes genéticos de resistencia, así como el contexto genético de estas, además de realizar análisis filogenómicos para determinar su relación clonal y la dinámica de diseminación en la interfase humano-animal-medioambiente.

BAZALAR GONZALES ,JHONATHAN ARTURO