Doctorado en Ciencias para el Desarrollo Sustentable

La producción de fibra de alpaca en el Perú es una de las actividades económicas más importantes de las poblaciones altoandinas, las cuales producen fibras de las razas Suri y Huacaya. Las características de la fibra entre ambas razas son distintivas y determinan su aplicación en la industria textil. Estas diferencias fenotípicas entre ambas razas han conllevado a la realización de varios estudios; no obstante, a pesar de encontrar resultados importantes, las limitaciones en el ensamblado y anotación del genoma de referencia hacen necesario el estudio de más variantes genómicas asociadas con la expresión del fenotipo de fibras largas. Es así que, el objetivo de este estudio es analizar las variantes genómicas y su asociación con la expresión del fenotipo de fibras largas en alpacas de las razas suri y huacaya. Para ello, se aplicarán dos metodologías que comprende la identificación de variantes estructurales en el genoma de la alpaca por medio del secuenciamiento de fragmentos largos usando la plataforma PacBio, y el estudio de asociación del genoma completo (GWAS) mediante el método de genotipado basado en secuenciación. En la primera metodología se colectarán muestras de sangre de 6 alpacas suri y 6 huacaya blancas, que cuenten con información genealógica y productiva se segunda esquila del Fundo Parcomarca, Puno. Mientras que para la segunda metodología se colectaran muestras de sangre de 280 alpacas procedentes de granjas de las regiones Puno y Pasco. La extracción, evaluación de concentración y calidad de ADN, para todas las muestras, se realizará en el Laboratorio de Biotecnología Animal de la Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza. El secuenciamiento y genotipado se realizará como servicio en el Laboratorio de Biotecnología de la Universidad Wisconsin-Madison, para luego realizar un análisis bioinformático que comprenderá el alineamiento, llamado, identificación y anotación de variantes genómicas en el Programa de Investigación y Proyección Social en Mejoramiento Animal de la Universidad Nacional Agraria La Molina. Es así que, el cumplimiento de los objetivos de esta investigación permitirá plantear planes y estrategias de mejoramiento genético, y desarrollar herramientas de selección que pueden ser utilizadas en programas de conservación y selección genética en las poblaciones de alpacas Suri.

PARIONA LA ROTTA ,JOAN ERICK