Doctorado en Ciencias de la Salud

La presente propuesta busca obtener y analizar genomas de bacterias KAPEc (Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Escherichia coli) multidrogo-resistentes (MDR) o extremadamente drogo-resistentes (XDR) de origen clínico, ambiental y animal provenientes de diversas regiones de Perú. Para la obtención de las cepas clínicas, se colaborará con un mínimo de cuatro hospitales de regiones diferentes. Las cepas ambientales y animales se obtendrán mediante muestreo en diferentes regiones, a partir de muestras de aguas y muestras alimentarias. Además, se cuenta con acceso a una colección de cepas MDR/XDR de las cuatro especies mencionadas, las cuales han sido aisladas en diferentes regiones de Perú y son de orígenes clínicos/ambientales/alimentarios. Se combinará secuenciamiento Illumina y Nanopore para el ensamblaje de novo de genomas circulares y detección de plásmidos y a partir de éstos se analizarán para obtener información de secuenciotipo (MLST), genes de resistencia a antimicrobianos, mutaciones puntuales que confieren resistencia a antibióticos, genes vinculados a virulencia, resistencia a metales pesados, estrés, entre otras características genómicas relacionadas con resistencia antibacteriana. Asimismo, se realizarán comparaciones filogenómicas entre cepas de la misma especie. La información obtenida servirá para elucidar detalles de epidemiología molecular de aislamientos KAPEc antibiótico-resistentes circulantes en Perú.

PALOMINO KOBAYASHI ,LUCIANO AUGUSTO