Bioprospección inteligente para la búsqueda de péptidos antimicrobianos provenientes de bacterias de origen ambiental

El aumento de microorganismos resistentes a los antimicrobianos (RAM) es un grave problema mundial de salud pública. Cada vez se reportan más patógenos resistentes, quedando así menos fármacos para contrarrestarlos. Por lo que, en la actualidad, se requiere la búsqueda de nuevas moléculas con propiedades antimicrobianas. Este proyecto emplearemos el uso de tecnologías ómicas, genómica para la detección de genes relacionados con las vías biosintéticas de metabolitos secundarios de los microorganismos identificados; la metabolómica y estructurómica para la búsqueda de posibles mecanismos de acción y mapeo de sus target y la peptidómica para el búsqueda y optimización de péptidos antimicrobianos. Además, se aplicarán herramientas bioinformáticas e inteligencia artificial como redes neuronales y Deep Learning con el fin de conseguir moléculas más activas y no tóxicas para las células eucarióticas. Luego se aislarán moléculas de microorganismos de origen ambiental, que se encuentran en biocustodia del Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología de la UNMSM. Para la obtención de estas moléculas se cocultivarán a escala de laboratorio los mejores microorganismos previos al screening de actividad antagónica; luego, se evaluará el secretoma de los mejores candidatos y dicho secretoma será fraccionado y concentrado en bolsas de dialisis para su posterior liofilización y separación por cromatografía líquida de alto performance (HPLC). Las moléculas antagonistas encontradas en los microorganismos evaluados serán enfrentados contra los patógenos. Finalmente, se identificarán las moléculas (péptidos) por espectrometría de masas, su estructura terciaria se dilucidarán por bioinformáticas. Este proyecto pretende contribuir en la búsqueda de nuevas moléculas para hacer frente a la resistencia antimicrobiana y obtener nuevas moléculas encontradas en microorganismos de origen peruano así como la creación de una base de datos de péptidos perunos de origen microbiano.