Fortalecimiento de capacidades bioinformáticas en análisis metagenómico para el diagnóstico molecular de patógenos en contextos clínicos y de salud pública

La propuesta de pasantía se enmarca en el proyecto de I+D+i “Protección de la salud pública mediante la vigilancia y el descubrimiento de virus en el Perú”, ejecutado por la Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH) y financiado por la Abbott Pandemic Defense Coalition (APDC), orientado al fortalecimiento de la vigilancia genómica y la detección temprana de patógenos emergentes mediante secuenciación metagenómica y análisis bioinformático avanzado. La pasantía, titulada “Fortalecimiento de capacidades bioinformáticas en análisis metagenómico para el diagnóstico molecular de patógenos en contextos clínicos y de salud pública”, se realizará en el Core de Diagnóstico Molecular de Abbott Laboratories, en Illinois, Estados Unidos, bajo la supervisión del Dr. Michael Berg. Abbott Laboratories es una entidad líder en diagnóstico molecular y vigilancia global de enfermedades infecciosas, con amplia experiencia en tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) y validación de metodologías aplicadas a entornos clínicos. El objetivo general de la pasantía es desarrollar competencias técnicas y analíticas en el procesamiento, análisis e interpretación de datos metagenómicos obtenidos de muestras clínicas. Entre los objetivos se incluyen la capacitación en control de calidad de datos NGS, implementación de pipelines bioinformáticos reproducibles, automatización de flujos de trabajo y comprensión de aspectos genómicos asociados al diagnóstico molecular. La pasantía tendrá una duración aproximada de cinco semanas, entre 26 de abril al 30 de mayo de 2026, con un plan de trabajo estructurado que contempla inducción institucional, capacitación progresiva en bioinformática aplicada, análisis de datos clínicos reales, revisión crítica de literatura y presentación de resultados. Al retorno, se realizará un taller híbrido de difusión y se elaborará un manual técnico validado, garantizando la transferencia de capacidades al Laboratorio de Malaria de la UPCH. Finalmente, se espera que esta experiencia fortalezca de manera sostenible las capacidades nacionales en vigilancia genómica y contribuya a mejorar la respuesta del país frente a enfermedades infecciosas emergentes.

ZUMAETA MARIN ,JHON ERIC