Prospección de genes conservados en el genoma de un organismo con potencial adaptativo al ambiente gástrico y su relación con la microbiota estomacal

La investigación surge ante la necesidad de comprender los mecanismos adaptativos de Streptococcus anginosus, un microorganismo emergente identificado en la microbiota gástrica y capaz de persistir en ambientes extremos como el estómago. Su estudio permitirá esclarecer procesos de adaptación microbiana con implicaciones en salud y biotecnología. La microbiota gástrica cumple un rol esencial en la homeostasis y en la génesis de enfermedades. Sin embargo, se desconoce cómo especies como S. anginosus influyen en la disbiosis y la reconfiguración microbiana gástrica. La hipótesis planteada es que el S. anginosus posee genes conservados y mecanismos adaptativos que le confieren resistencia al estrés ácido y oxidativo, favoreciendo su persistencia y capacidad de modular la microbiota gástrica. La metodología a utilizar será exploratoria-descriptiva con enfoque genómico, metagenómico y filogenético. Se emplearán cepas de un biobanco de referencia, cultivadas para la obtención de ADN y posterior secuenciación de nueva generación. El proyecto tiene por objetivo general caracterizar los genes conservados en el genoma de Streptococcus anginosus que están asociados con su capacidad adaptativa al ambiente gástrico extremo e investigar su influencia en las interacciones ecológicas y evolutivas con la microbiota estomacal mediante un enfoque integrador basado en genómica, metagenómica y filogenética. Los objetivos específicos son aislar y cultivar S. anginosus a partir de muestras de un biobanco de referencia; Secuenciar el genoma completo de S. anginosus e identificar genes conservados y rutas metabólicas involucradas en su adaptación al ambiente gástrico extremo; explorar las interacciones ecológicas de S. anginosus con la microbiota gástrica mediante enfoques metagenómicos y determinar la estructura y funcionalidad de la comunidad microbiana en el ambiente gástrico; y determinar mediante análisis filogenético la posición evolutiva de S. anginosus y evaluar eventos de transferencia horizontal de genes y adaptaciones convergentes con otros microorganismos extremófilos. El resultado esperado de esta investigación es obtener un mapa genómico y filogenético de S. anginosus que permita identificar mecanismos adaptativos clave y evidenciar su rol en la dinámica microbiana gástrica. Asimismo, los resultados bibliográficos esperados son 01 tesis de pregrado presentada para su sustentación, 01 articulo aceptado para publicación en revistas indizadas en Scopus, 01 ponencia en eventos nacionales y 01 conferencia de difusión de resultados. Los hallazgos fortalecerán la comprensión de la ecología y evolución microbiana en ambientes extremos, aportando potenciales marcadores moleculares con potencial biotecnológico y consolidando líneas de investigación en bioquímica y biología molecular mediante colaboración científica.