Determinación de la etiología de la mortandad del algarrobo (Neltuma sp.) observada en los bosques secos del Norte del Perú, mediante diagnóstico molecular y bioensayos

El presente proyecto propone verificar el agente etiológico del Síndrome de la Mortandad del Algarrobo (SMA) a través de bioensayos de exposición experimental en invernadero, indexación vegetal y del desarrollo de herramientas de diagnóstico molecular. En un primer tiempo, en UDEP se producirán cientos de plantones a partir de semillas recuperadas de árboles de Neltuma sp. asintomáticos proveniente de zonas aparentemente poca afectadas por el Síndrome de la mortalidad del Algarrobo (SMA). Luego se conducirá bioensayos de exposición con insectos e indexación de plantones con injertos de cortezas de plantas sintomáticas y asintomáticas para evaluar los síntomas y efectos, determinar la transmisibilidad de la enfermedad y analizar las cargas virales en cuanto a la aparición o aumento de síntomas. En paralelo en IB se realizarán pruebas de RT-qPCR específicas para closterovirus basándonos en las secuencia obtenida previamente y sondas degeneradas “universales” que podrían reconocer a los closterovirus. A su vez, se extraerá el ARN total de plantas sintomáticas el cual será enviado a análisis de transcriptómica de tipo RNAseq para identificar y secuenciar a profundidad todos los virus presentes en la muestra. Este potente análisis bioinformática será realizado por los especialistas del INRAE. Además de validar la presencia de closterovirus la obtención de los genomas virales permitiría diseñar otras sondas de tipo qPCR en respaldo a la primera actividad o por si estuviéramos en presencia de coinfecciones virales o de otros microorganismos. El diagnóstico por RT-qPCR permitirán cuantificar precisamente las cargas virales en arboles sintomáticos, asintomáticos, vectores y definir prevalencias en las poblaciones de algarrobos de Tumbes, Piura y Lambayeque. En conjunto estas evidencias deben confirmar la etiología viral de la mortandad del algarrobo y a la vez obtener información y herramientas que permitirán desarrollar estrategias de conservación.