Develando procesos evolutivos de la biodiversidad peruana a una escala genómica: Diversidad genética, introgresión y especiación en taxa con tiempos evolutivos cortos.

El estudio de la biodiversidad es crucial ante la crisis ambiental y la rápida desaparición de las especies. Descubrir no solo la biodiversidad existente, sino los procesos evolutivos involucrados, es primordial para los programas de conservación. El presente proyecto se plantea distintas preguntas de investigación, todas en torno a la genómica evolutiva de la biodiversidad peruana. El presente proyecto representa un salto cualitativo en el estudio de nuestra biodiversidad y presenta soluciones a temas que han representado problemas para nuestros científicos por décadas, al tratarse de grupos con tiempos evolutivos cortos, donde marcadores tradicionales no han conseguido acumular el suficiente polimorfismo para ser informativos. Los casos modelos aquí escogidos representan taxa diversos y regiones diversas, incluyendo mar, costa, sierra y selva. En el presente proyecto proponemos la utilización del Genotipado por Secuenciación (GBS) para estudios de biodiversidad, desvelando los misterios de procesos evolutivos en cinco organismos no modelos. Estudiaremos la manutención de la diversidad genética en el caracol manzana gigante de la amazonia Pomacea sp. y diversificación en dos especies hermanas, la diversidad presente en variedades del cacao nativo Theobroma cacao de la región Amazonas, la introgresión en las especies de pulpo de Pacífico Octopus mimus y Octopus hubbsorum y el proceso de especiación en los peces del género Orestias y la mosca de la fruta sudamericana Anastrepha. El uso del Genotipado por Secuenciación, una técnica de representación reducida del genoma representa el siguiente paso en el compromiso de los científicos y del país en el estudio y conservación de la biodiversidad. El proyecto cuenta con todo el equipamiento necesario para su ejecución en ambas instituciones, la ejecutora y asociada. El investigador principal viene trabajando con GBS en proyectos que fueron financiados con fondos concursables. El equipo multidisciplinario permitirá el trabajo en distintos taxa y ambientes. La limitante de la bioinformática será superada gracias al entrenamiento del investigador principal y los recursos computacionales que cuentan las instituciones participantes. Los resultados producirán al menos cinco artículos científicos presentados revistas indizadas de alto impacto (Q1 o Q2), además de cinco ponencias realizadas en congresos nacionales y/o internacionales. La contribución científica del presente proyecto incluye el desarrollo de dos tesis de maestría, lo que permitirá contribuir en la formación científica de los estudiantes e incentivará los programas de posgrado de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, promoviendo la capacitación de talento humano. El proyecto tendrá un impacto ambiental, ya que permitirá entender componentes de la biodiversidad importantes para la conservación, como lo son, la diversidad de especies y la diversidad genética. La sostenibilidad de la línea de investigación en las entidades está garantizada dado que todos los investigadores son docentes nombrados por las universidades, cuentan con doctorado, son investigadores RENACYT y cuentan con publicaciones en los últimos años, que demuestran el esfuerzo que vienen realizando en sus respectivas especialidades. El presente proyecto es una consolidación de la línea de investigación, y permitirá el desarrollo de más investigaciones usando datos genómicos dispersos en el genoma para estudiar la biodiversidad.