OnePeru: Plataforma bioinformática peruana para contribuir en la lucha contra la resistencia antimicrobiana

Una plataforma bioinformática permitiría recopilar y analizar datos genómicos de cepas bacterianas aisladas en Perú, lo que proporcionaría información esencial para comprender la base genética de la resistencia, la cual está ligada a factores genéticos. Una plataforma de este tipo facilitaría la vigilancia y el monitoreo continuo de las tendencias de resistencia antimicrobiana en tiempo real. La información genómica recopilada puede ser utilizada para desarrollar estrategias de tratamiento personalizadas y adaptadas a las características específicas de las cepas presentes en Perú. Esto mejoraría la eficacia de los tratamientos y reduciría el riesgo de propagación de la resistencia. Una plataforma bioinformática también podría servir como herramienta de concientización y educación, proporcionando información accesible sobre la resistencia antimicrobiana a profesionales de la salud, investigadores, y la comunidad en general. Ante el incremento de microorganismos mutidrogoresistentes (MDR) en todo el mundo, urge la necesidad de sistematizar la información resultante del secuenciamiento genómico, sobre la resistencia antimicrobiana circulante en nuestro país, en una base de datos de genomas y genes circulantes de bacterias MDR, para realizar la vigilancia epidemiológica de la resistencia antimicrobiana en tiempo real. Hipótesis: Existe una variabilidad genómica significativa de los aislados bacterianos MDR procedentes de muestras clínicas y ambientales de 03 regiones del Perú. La metodología a utilizar es cualitativa, de carácter observacional y según la temporalidad de los hechos, descriptiva transversal y comparativa. El objetivo de la investigación es desarrollar, implementar y consolidar la plataforma bioinformática "OnePeru" como una herramienta integral para la vigilancia, diagnóstico, gestión y tratamiento de la resistencia antimicrobiana en aislados bacterianos de Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii a partir de ADN de muestras humano/animal y ambiental secuenciadas procedentes de tres regiones de Perú. La investigación se iniciará el diseño e implementación de la plataforma bioinformática, además se procederá con la recolección y curado de secuencias genómicas peruanas libres siguiendo las mejores prácticas de evaluación de calidad de las cuatro bacterias resistentes a los antimicrobianos de prioridad crítica para la OMS que son E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii a partir de otras bases de datos de acceso abierto para poder concentrar la información en la plataforma bioinformática “OnePeru”. Luego, se procederá a la alimentación de esta plataforma con nuevas secuencias genómicas peruanas a partir de aislados bacterianos procedentes de muestras clínicas, animales y ambientales. Uno de los resultados esperados es obtener una plataforma bioinformática desarrollada, implementada con los genomas secuenciados de bacterias multidrogoresistentes validada, de acceso abierto. Esta plataforma peruana podría integrarse con esfuerzos internacionales y compartir datos relevantes para abordar la resistencia a nivel global.