Establecimiento de un mapa físico preliminar de marcadores moleculares de polimorfismo de nucleótido simple (SNP) en alpaca (Vicugna pacos) en base a información obtenida con un chip de bovinos (Bovine HD genotyping BeadChip)

El objetivo general del proyecto es el establecimiento de un mapa físico preliminar de marcadores moleculares de Polimorfismo de Nucleótido Simple (SNP) en Alpaca (Vicugna pacos) en base a información obtenida con un chip de Bovinos (Bovine HD Genotyping Beadchip) Los objetivos específicos son: a) Identificar las secuencias de marcadores SNP que resultaron positivos con el chip bovino (Bovine HD Genotyping Beadchip), y a su vez identificar dichas secuencias en el Genoma base de Alpaca disponible en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI); b) Estimar la relación de ligamiento entre marcadores SNP de Alpaca mediante el uso de un panel celular hibrido (Alpaca/hámster) irradiado para localizar marcadores SNP en relación a otros; c) Desarrollo de un mapa físico de SNPs de Alpaca basado en la localización física cromosómica de grupos de marcadores ligados mediante la técnica de Hibridación in situ con fluorescencia (FISH). La metodología de investigación se concreta en lo siguiente: a) Análisis in sílico de reporte generado con Chip de bovino en genoma de Alpaca. b) Uso de Mapas de radiación hibrida para todo el genoma (“Whole genome radiation hybrid maps” WGRHM) para determinar asociación de marcadores SNP. c) Uso de Hibridación in situ con fluorescencia (Fluorescence in situ hybridization, FISH) para determinar mapa físico de marcadores SNP en Alpaca. Los resultados esperados son: a) Obtención de Mapa físico preliminar de marcadores SNP en Alpaca. b) Identificación de las secuencias de marcadores SNP que resultaron positivos con el chip bovino (Bovine HD Genotyping Beadchip). c) Obtener mapa genético de ligamiento de marcadores SNP en Alpaca. d) Obtener mapa físico de localización de marcadores SNP en cromosomas de Alpaca e) Panel preliminar de SNP para desarrollar en un futuro un CHIP de SNP para Alpaca f) 01 Tesis de Maestría en Producción Animal, tesis propuesta: “Mapeo de Marcadores moleculares SNP mediante uso de radiación hibrida en genoma Alpaca (Vicugna pacos)”. g) 01 Tesis de Ing. Zootecnista, tesis propuesta: “Análisis in silico de reporte generado con chip de bovino (Bovine HD Genotyping Beadchip) sobre el genoma de Alpaca (Vicugna pacos)”; h) 02 Publicación en Revista Indizadas; i) 02 Presentaciones en Congreso Científico. La Entidad Ejecutora es la Universidad Nacional Agraria La Molina (Lima).