Molecular characterization of Peruvian fine flavor cacao germplasm using SNPs genotyping

Los cacaos aromáticos del Perú son considerados entre los mejores chocolates del mundo por sus exquisitas y poco comunes caracteristicas organolépticas. Por eso, tiene un alto valor comercial en los mercados internacionales y es reconocido como un cacao gourmet por excelencia. A pesar de su alto valor comercial, poco se sabe sobre su perfil genético por lo que es altamente vulnerable a erosiones genéticas o pérdidas de sus cualidades únicas por desconocimiento de relación de parentesco con otras razas nativas e híbridos tradicionales. En esta pasantia se propone determinar mediante tecnologias de genotipificacion SNPs en la caracterizacion de la diversidad de cacao fino y de aroma y la identificacin de accesiones élite que puedan servir para integrarse a un programa de mejoramiento genético, teniendo en cuenta que un problema asociado a este cultivar es su susceptibilidad a enfermedades. Además, la apropiada identificación de los ecotipos y razas y su detallado perfil haplotípico permitirá la salvaguardia de los recursos nativos con denominación de origen. Para ello se evaluarán y compararán accesiones de regiones donde se han reportado estas variedades comparando con cacaos tradicionales y de origen internacional utilizados por los agricultores locales. Adicionalmente, en el marco de un proyecto colaborativo se usaran marcadores moleculares multialelicos (tipo SSR) y secuenciamiento masivo para determinar secuencias específicas de genes asociados a calidad y resistencia. Finalmente, nuestra asociación con productores beneficiarios finales, hará que la aplicación de estos conocimientos tengan un gran impacto.

CHIA WONG ,JULIO ALFONSO