Hostpathogen interactions in Multidrog Resistant Tuberculosis (MDRTB): Study of the Molecular Epidemiology, Host Immune Responses and Genome Based Prediction and Early Identification of MDRTB in High Tuberculosis Burden Settings

El objetivo de esta propuesta es estudiar las interacciones huésped-patógeno en tuberculosis multidrogo-resistante (TB MDR) con el propósito final de detección temprana y prevención de TB MDR. Planeamos conducir caracterización genotípica de cepas clínicas de TB MDR y determinar las respuestas inmunes en pacientes con tuberculosis drogo-susceptible (TB DS) y TB MDR en el Callao, Peru y Minas Gerais, Brazil. Los estudios genómicos del patógeno incluirán la evaluación de transmisión de TB MDR usando 14-loci mycobacterial interspersed repetitive units-variable number of tandem repeats (MIRU-VNTR) y secuenciación del genoma completo (WGS por sus siglas en inglés); implementación de las novedosas aplicaciones de software Phylo-Resistance Search Engine (PhyResSE) and Mykrobe tanto para la caracterización de información de resistencia a drogas y linaje como para la detección de TB MDR utilizando datos de WGS de las cepas clínicas; y la caracterización de small regulatory RNAs (sRNAs) como novedosos marcadores genéticos de resistencia a drogas. Los estudios de inmunidad del huésped incluirán análisis de importantes citoquinas en plasma y mediadores lipídicos así como el inmunofenotipo leucocitario en personas con TB MDR, comparado con TB DS. Nuestros resultados soportarán la validez y permitirán la implementación de métodos basados en análisis genómico para la predicción y detección temprana de la ocurrencia y transmisión de TB MDR en áreas endémicas de TB como lo son Perú y Brazil, y generará conocimiento de respuestas inmunes disfuncionales que podrían ser usadas como biomarcadores de TB MDR. Más aún, los resultados de este proyecto proveerán información para futuras intervenciones de predicción y prevención enfocadas en disminuir la ocurrencia y complicaciones relacionadas a TB MDR en áreas con una similar carga de TB dentro de la región. Nuestro consorcio de trabajo está conformado por el Centro de Investigaciones Tecnológicas, Biomédicas y Medioambientales (CITBM) en Perú, la Universidade Federal de Minas Gerais en Brazil, el Research Center Borstel en Alemania, el Hospital Sant Joan de Deu en España, el IRCCS Ospedale San Raffaele en Italia, y Bioaster en Francia. El CITBM tiene el rol de centro coordinador general del proyecto.