Burkholderia fitobenéfica y fitopatógena asociadas al cultivo de arroz en la región San Martín: Análisis genómico, taxonómico y de diversidad para una mejor comprensión de su uso en la agricultura

Introducción: Burkholderia es una bacteria con gran potencial biotecnológico. El empleo de sus células o productos pueden emplearse para descontaminar ambientes, reducir el uso de agroquímicos en la agricultura, y obtener nuevos antibióticos. Sin embargo, la taxonomía de este grupo bacteriano no esta del todo resuelta, existen especies que son ambientales, asociadas a plantas, y pueden comportarse como fitobenéficos, fitopatógenos e incluso como patógenos oportunistas. Problema: Algunas cepas de Burkholderia asociadas al arroz han demostrado ser potenciales inoculantes, pero podrían ser consideradas patógenas debido a que su taxonomía no está bien definida. El estudio de la diversidad genómica de cepas peruanas y de otras partes del mundo permitirá separarlas adecuadamente y replantear su utilidad en la agricultura. Método de investigación: El estudio empleará el Modelo Método de la Investigación Científica (MIC), el cual ante el problema de que la taxonomía del género Burkholderia no está del todo resuelta, la secuenciación del genoma de cepas peruanas de Burkholderia conducirá a inferir conclusiones para su empleo y/o control en la agricultura. Hipótesis: Explicativa: El estudio de la diversidad genética y genómica de cepas peruanas de Burkholderia fitobenéficas y fitopatógenas asociadas a arroz permitirá una mejor comprensión de su empleo, tanto como inoculantes o para su control en la agricultura, respectivamente. Objetivo general: Obtener un mejor entendimiento de la diversidad genética y genómica de cepas peruanas de Burkholderia con potencial fitobenéfico y fitopatógeno asociadas al cultivo de arroz. Objetivos específicos: 1. Identificar aislados de Burkholderia fitobenéficas y fitopatógenas en arroz. 2. Evaluar el potencial fitobenéfico y fitopatógeno de cepas de Burkholderia. 3. Reconstruir los genomas de cepas peruanas de Burkholderia fitobenéficas y fitopatógenas. 4. Analizar la diversidad genética y relaciones evolucionarias entre cepas peruanas de Burkholderia y de otras partes del mundo Resultado esperado: Revelar la verdadera identidad de cepas peruanas de Burkholderia fitobenéficas y fitopatógenas asociadas al arroz discerniendo su potencial de uso en la agricultura, así como su relación con cepas de Burkholderia de otras partes del mundo. Impacto de la investigación: Social: Concientización sobre la conservación y bioprospección de recursos genéticos microbianos. Económico: Fuente de innovación para el desarrollo de patentes y aliciente para futuras industrias de inoculantes. Ambiental: Reducción del uso de agroquímicos por el empleo de Burkholderia fitobenéfica y mejor control de Burkholderia fitopatógena. Académico: Implementación de la línea de investigación en genómica microbiana e interacción planta-microorganismo y formación de recursos humanos.