Arquitectura genética de COVID-19 en la población peruana: GWAS como estratégia para la identificación de biomarcadores de progresión a sintomatología grave e identificación de nuevos blancos terapéuticos.

La evolución clínica del Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS, por sus siglas en inglés) asociado a la infección por SARS-CoV-2 es crítica y no se conocen biomarcadores asociados con su progresión. En general, dos lagunas en el conocimiento existente son la arquitectura genética de la población susceptible a infecciones respiratorias agudas y el conocimiento sobre la genética de poblaciones con alto componente indígena como la peruana, que solo recién se está estudiando con mayor intensidad. Recientemente, se ha destacado la importancia de los receptores humanos ACE2 y de la serina proteasa TMPRSS2 por ser puertas de ingreso del virus hacia su célula blanco, así como a la tormenta de citoquinas como desencadenante de una inflamación generalizada pudiendo ocasionar muerte del paciente. Estos datos resaltan la importancia de caracterizar la arquitectura genética de la población peruana ante esta pandemia que ayude a identificar grupos poblacionales de riesgo a desarrollar síntomas severos y por tanto contribuir a políticas de salud orientadas a directrices de prevención. Proponemos aplicar un enfoque de análisis de asociación genómica humana translacional (variantes exónicas) (GWAS) para identificar los genes humanos asociados con la progresión a formas graves de COVID-19 y un enfoque farmacogenómico-bioinformático para identificar nuevos albos terapéuticos a partir de las variantes encontradas para reposicionamiento de fármacos. Este estudio involucra el análisis genómico de 300 pacientes con COVID-19 con diferentes niveles de severidad, medida en función del tipo de hospitalización (normal o en UCI), como también pacientes no hospitalizados, todo esto usando un diseño caso-control. Objetivos específicos: 1) Evaluar si la progresión a formas graves de COVID-19 está asociada a ancestralidad nativo-americana, europea o africana, independientemente del status socio-económico y otras co-variables; 2) Identificar las variantes genéticas asociadas con susceptibilidad a desarrollar sintomatología grave de COVID-19 usando un enfoque GWAS, independiente de las comorbilidades y otros factores biológicos; 3) Identificar posibles blancos de fármacos por medio de métodos bioinformáticos a partir de las variantes genéticas asociadas con la patogénesis de COVID-19 severo; 4) Evaluar el efecto de la ancestralidad genética en la expresión de los genes ACE2, TMPRSS2 y SLC6A20 y COVID-19 severo en la población peruana. Se tomará una muestra de sangre venosa para el análisis genético e hisopado nasofaríngeo para el análisis de expresión de genes del paciente. Adicionalmente, se medirán los títulos de anticuerpos y virus como factores de riesgo de severidad. Se hará colecta de información de la ficha epidemiológica del MINSA y de la historia clínica de cada participante.