"Desarrollo de un Biosensor portátil y versátil basado en el Sistema CRISPR\/Cas para la detección rápida, sensible, específica y de bajo costo de múltiples patógenos que causan la malaria en aves en la Amazonía Peruana."

En los últimos años, se han secuenciado ampliamente los genomas aviares, por ejemplo, actualmente existe un proyecto donde se están secuenciando 10000 especies de aves existentes. Sin embargo, a la fecha solo se han secuenciado tres genomas de malaria aviar, a pesar de que se han identificado > 3100 linajes únicos. Esta disparidad existe debido a la dificultad de separar las células del parásito del huésped. El genoma de las aves es aproximadamente 50 veces más grande que los de los parásitos de la malaria y debido a que la parasitemia es con frecuencia <0.01% y los glóbulos rojos de las aves están nucleados, las extracciones de ADN están compuestas casi en su totalidad por el huésped. Lo cual significa que, a partir de estas muestras, se necesitarían unos 98 mil millones de lecturas de Illumina para secuenciar un genoma único con una cobertura de 20x. Sin embargo, el método utilizado para identificar linajes de parásitos durante los últimos 20 años sigue siendo el mismo, esta es una técnica de código de barras de ADN de facto de aproximadamente 500 pb. En consecuencia, nuestra capacidad para delimitar especies, construir filogenias robustas, documentar distribuciones espaciales de especies y determinar eventos de cambio de huésped es limitada. Por lo que, el proyecto tiene como objetivo principal desarrollar un Biosensor portátil y versátil basado en el sistema CRISPR/Cas para la detección rápida, sensible, específica y de bajo costo de múltiples patógenos que causan la malaria en aves en la Amazonía Peruana. Para cumplir con este objetivo se tomará una muestra de sangre fresca de aves capturadas con redes de neblina, se estandarizará el protocolo de extracción de ADN genómico. Se analizarán las muestras de sangre para detectar infecciones por malaria aviar utilizando el protocolo de PCR anidado, las reacciones positivas se limpiarán enzimáticamente y utilizarán técnicas de secuenciamiento para producir aproximadamente = 9 genomas de malaria aviar aislando y/o amplificando selectivamente el ADN del parásito, degradando el ADN del huésped o ambos. Usando estos genomas resultantes, se desarrollará un biosensor basado en campo para diagnosticar la malaria aviar sin ningún equipo especializado, lo que facilitará inventarios amplios y rápidos de la malaria aviar en todo el Perú, disminuyendo el riesgo de transmisión e infección en especies de aves que podrían fomentar la aparición de parásitos más virulentos llevándolos al borde de la extinción local.