Implementación de un sistema de fraccionamiento celular y subcelular para aplicaciones en biología molecular y biotecnología.

El Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología de la Facultad de Ciencias Biológicas de la UNMSM no cuenta con una unidad de ultracentrífugación ni con un cromatógrafo de alta presión (HPLC) que permita avanzar en las investigaciones a nivel subcelular o molecular. La ultracentrífuga a adquirir, debido a que alcanza una fuerza centrífuga de hasta 800,000 g, facilitará el desarrollo de investigaciones de macromoléculas orgánicas asociadas a compartimentos u organelos específicos, que de otra forma no son recuperables debido a su menor tamaño. La propuesta se asocia al estudio del genoma y transcriptoma ambiental de forma directa, mejorando los rendimientos de recuperación de dichas moléculas a partir de muestras ambientales, que de forma convencional dependen directamente del método de extracción, el cual genera sesgos frecuentes en los resultados. Nuestra propuesta permitirá potenciar el uso de tecnologías NGS (secuenciador MiSeq) así como se mejorará el flujo de trabajo de las investigaciones colaborativas del laboratorio y la facultad. Por otra parte, permitirá el estudio de partículas virales recuperadas por centrifugación fraccional, lo cual es imposible lograr con los equipos convencionales. Por otro lado, el cromatógrafo de alta presión (HPLC) permitirá separar y purificar proteínas en función de su hidrofobicidad. Actualmente los estudios realizados con proteínas microbianas en el laboratorio se basan en la separación de éstas por electroforesis que no permite estudiar las proteínas de las fracciones subcelulares. Por tanto, ambos equipos son de mucha importancia para la implementación de estudios proteómicos a nivel subcelular y molecular con posibles aplicaciones biotecnológicas.