Arquitectura transcriptómica basal en la modulación de la respuesta molecular y funcional al 5-Fluorouracilo y Oxaliplatino en modelos primarios de adenocarcinoma gástrico de pacientes peruanos

El adenocarcinoma gástrico es la principal causa de mortalidad oncológica en el Perú. A pesar del uso estandarizado de quimioterapia basada en fluoropirimidinas (5-Fluorouracilo) y sales de platino (Oxaliplatino), una alta proporción de pacientes experimenta falla terapéutica por quimiorresistencia intrínseca. Se postula que el adenocarcinoma gástrico posee una arquitectura transcriptómica basal definida, reflejo de su identidad molecular tumor-intrínseca, de la cual un conjunto de programas transcriptómicos centrales se conserva parcialmente durante la transición del tumor primario a modelos primarios de adenocarcinoma gástrico establecidos in vitro. El presente estudio de investigación básica orientada busca dilucidar cómo esta firma molecular persistente establece estados celulares que modulan la respuesta biológica frente al tratamiento. Metodológicamente, se colectarán muestras tumorales ex vivo, adicionalmente se establecerán cultivos tridimensionales tumorales primarios a partir de tejidos tumorales resecados de pacientes peruanos con cáncer gástrico en estadios II–III. Se empleará secuenciación masiva de ARN (RNA-Seq) en tres estados transcriptómicos pareados por paciente: (i) el tejido tumoral fresco criopreservado ex vivo, que representa el transcriptoma original del tumor; (ii) el esferoide primario en condición basal, sin exposición farmacológica, para evaluar qué programas de coexpresión génica del tumor original se conservan parcialmente en el modelo tridimensional; y (iii) el esferoide tras exposición al esquema combinado 5-FU + oxaliplatino, para capturar la reconfiguración transcriptómica inducida por el estrés genotóxico. La comparación (i) vs. (ii) validará la fidelidad biológica del modelo in vitro; la comparación (ii) vs. (iii) identificará los programas de adaptación y evasión farmacológica. La susceptibilidad funcional se cuantificará mediante métricas de inhibición del crecimiento normalizado por tasa de proliferación (metricas GR: GR50, GRmax, GRAOC), y los módulos de coexpresión génica y genes orquestadores (hub genes) de la resistencia se identificarán mediante el Análisis de Redes de Coexpresión Génica Ponderada (WGCNA). Los resultados proporcionarán evidencia científica inédita sobre la biología del adenocarcinoma gástrico en la población peruana, sentando las bases para futuras investigaciones en oncología de precisión y farmacogenómica poblacional