PeptiSym: Descifrando la reprogramación transcriptómica inducida por péptidos en interacciones simbióticas y patogénicas

PeptiSym es un proyecto que estudiará cómo señales naturales producidas por el frijol pueden cambiar, desde los primeros días, la forma en que la raíz responde cuando se encuentra con un microbio beneficioso o con un organismo dañino. En el suelo, la raíz puede convivir con bacterias que ayudan a la planta y, al mismo tiempo, ser atacada por nematodos que forman agallas y debilitan el cultivo. La gran pregunta es qué ocurre en esas primeras horas y días, cuando la planta define qué programas de defensa o de cooperación activa, y cómo esas señales internas influyen en esa respuesta. Para responderlo se trabajará con plántulas de frijol de siete días. A un grupo se le aplicarán dos péptidos naturales del frijol y a otro no. Luego, las plantas se inocularán con una bacteria beneficiosa asociada a la fijación de nitrógeno (Rhizobium tropici), con un nematodo formador de agallas (Meloidogyne incognita), o con ambos a la vez. Se tomarán raíces al día y a los cuatro días después de la inoculación. Con esas raíces se extraerá el ácido ribonucleico y se usará secuenciación masiva para medir qué genes están más activos o menos activos en cada situación. Después se analizarán los datos con herramientas bioinformáticas para identificar rutas y grupos de genes que cambian coordinadamente, y se confirmará un conjunto de genes clave con una prueba independiente. Se espera obtener un mapa claro de la respuesta temprana del frijol frente a la interacción beneficiosa, la interacción dañina y su coexistencia, y revelar cómo los péptidos del frijol modifican esas respuestas. El impacto principal será generar conocimiento básico de frontera sobre la comunicación entre raíces y organismos del suelo en plantas cultivadas, dejando bases sólidas para futuras investigaciones que busquen favorecer interacciones beneficiosas y reducir el daño por patógenos con enfoques más precisos y basados en evidencia.