El Aerobioma de la Amazonía: Una perspectiva metagenómica como bioindicador del cambio ambiental

El aerobioma describe el conjunto de microorganismos y partículas biológicas presentes en el aire e incluye a bacterias, hongos y polen. Aunque recientemente ha cobrado importancia por su papel en la dispersión de patógenos humanos, aún existen pocos estudios que lo analicen en relación con procesos ecosistémicos como la migración de especies, la fertilización y la respuesta de los ecosistemas a perturbaciones naturales o antropogénicas. Este proyecto propone estudiar el aerobioma de bosque tropical como indicador de la dinámica ecológica en un contexto de cambio climático. Para ello, se utilizarán torres de monitoreo de la red AndesFlux en la Amazonía occidental, recolectando aerosoles a lo largo de un gradiente geográfico y estacional. Las muestras serán analizadas mediante metabarcoding y secuenciación metagenómica, lo que permitirá caracterizar la diversidad y el potencial funcional de los microorganismos presentes. Las muestras, recolectadas mediante un sistema autónomo y automatizado, serán analizadas en diferentes períodos estacionales con técnicas moleculares y bioinformáticas. Específicamente, realizaremos metabarcoding utilizando marcadores moleculares específicos para plantas, hongos y bacterias, como el espaciador intergénico trnL-trnF, el ITS-2 y el 16S ADNr, respectivamente. Además, se llevará a cabo secuenciación metagenómica aleatoria (shotgun) en las muestras más prometedoras, con el fin de evaluar el potencial metabólico del microbioma e intentar reconstruir genomas de alta calidad a partir de los metagenomas. Los resultados esperados de esta investigación son: obtener protocolos estandarizados de muestreo y análisis para evaluar la influencia de factores ambientales en la dinámica de liberación de microorganismos y esporas desde sus matrices de origen, perfiles estacionales (temporada seca, de transición y de lluvias) de composición del aerobioma, y algoritmos de relación de variables ambientales (velocidad/dirección del viento, humedad, temperatura y estacionalidad) con la diversidad y abundancia de organismos presentes (vegetación y suelo) en el aerobioma. Asimismo, los resultados bibliográficos esperados son: (02) artículos científicos originales publicados o aceptados para publicación en revistas, preferentemente de acceso abierto, indizadas en Scopus o WoS en Q1 o Q2, (02) tesis finalizadas postgrado sustentadas durante el período de ejecución del proyecto, y (01) ponencia o presentación de póster en congresos de alcance internacional.