Metabarcodificación del ADN ambiental aerotransportado para monitorear comunidades de fauna silvestre en la Reserva Nacional Pacaya Samiria: validación de concepto en un área natural.

Monitoreos tradicionales realizados durante la última década en la Reserva Nacional Pacaya Samiria (RNPS) mostraron una disminución en las poblaciones de comunidades de fauna silvestre, más sorprendentemente aún, la ausencia de grupos de vertebrados y ungulados terrestres en sus hábitat natural. Además, el cambio climático y la caza furtiva fueron reportados como los principales causantes de estos eventos. Desafortunadamente, los monitoreos se suspendieron el año 2015 debido a la falta de taxónomos, elevados costos, al gran esfuerzo que esta actividad requiere, etc. La innovación de técnicas como el reconocimiento simultáneo de múltiples taxa conjuntamente con la tecnología del ADN ambiental (eDNA en inglés) han revolucionado la forma de biomonitoreo. La metabarcodificación del eDNA del aire como herramienta para el monitoreo de fauna silvestre en medios naturales aún no ha sido explorada y necesita ser investigada. El estudio abordará preguntas fundamentales relacionadas al desempeño de la captura y detección del eDNA del aire mediante el test de un dispositivo de colecta en 72 muestras (considerando 2 réplicas) provenientes de la RNPS. El eDNA del aire será extraído usando el kit de extracción comercial QIAGEN Blood & Tissue. La metabarcodificación será determinada mediante marcadores moleculares para vertebrados y mamíferos. Para la secuenciación se usará la plataforma Illumina Miseq. Los clusters de secuencias filtradas con una similitud del 97% se agruparán en Unidades Taxonómicas Operativas (OTUs), mientras que la validación de especies será determinada a un porcentaje de similitud del 100% con una secuencia de referencia de la plataforma del Centro Nacional para Información Biológica (NCBI). Análisis de ANOVA de dos factores y prueba-T determinarán si los siete factores ambientales (sustrato, temperatura, etc) a ser estudiados influencian la detección del eDNA aerotransportado. La presente investigación es el primer intento en usar una técnica de monitoreo de vanguardia basada en el eDNA del aire en ecosistemas naturales. Los potenciales resultados facilitarán la cobertura espacio temporal de los monitoreos, la gestión y la conservación de áreas naturales.