Análisis genómico de Escherichia coli resistente a la colistina aisladas de mosca doméstica y heces de vacunos y porcinos procedentes de mataderos de Lima Metropolitana

Los mecanismos de diseminación y las vías de transmisión de las bacterias resistentes a antimicrobianos (BRA) asociados al ganado, y a los humanos se centran principalmente en la cadena alimentaria. En este sentido el problema identificado esta relacionado con conocer las posibles rutas de diseminación de BRA a través del medio ambiente, y las moscas, esta ultimas pueden encontrarse en los hábitats del ganado y los humanos, y se mueven libremente debido a su capacidad para volar y pueden diseminar BRA. El método de investigación es determinar la resistencia fenotípica de colistina, además de identificar genes mcr mediante PCR de cepas de E. coli aislados de moscas y heces de vacuno y porcino. Posteriormente realizar el secuenciamiento masivo de las cepas resistentes. El análisis bioinformático se realizará con diferentes programas para el análisis filogenómico, la determinación de genes de resistencia, genes de virulencia, linaje genético, y elementos genéticos móviles responsables de la resistencia a la colistina. Además, como objetivo general se pretende analizar el genoma completo de E. coli resistente a la colistina aislados de mosca doméstica, y heces de vacunos y porcinos procedentes de mataderos de Lima Metropolitana. Asimismo, para el cumplimiento del objetivo general, se plantean los siguientes objetivos específicos: i. Determinar la concentración mínima inhibitoria de la colistina de aislados de E.coli, mediante el método de microdilución. ii. Detectar molecularmente la presencia del gen de resistencia mcr en los aislados de E.coli procedentes de moscas domésticas, heces de vacunos, y porcinos. iii. Determinar el linaje genético de los aislados de E.coli resistente a la colistina mediante secuenciamiento del genoma completo. iv. Identificar los elementos genéticos móviles asociados a la resistente a colistina en aislados de E. coli resistente a la colistina, mediante secuenciamiento del genoma completo. Como resultado esperado se tendrá evidencia de la presencia de genes mcr en cepas de E.coli, aislados de mosca y heces de cerdo y bovino, asimismo conocer el linaje genético de los aislados de E.coli resistente a la colistina mediante secuenciamiento del genoma completo. El impacto de los resultados es brindar información actualizada sobre la presencia de E. coli con genes de resistencia a la colistina (mcr) provenientes de la mosca doméstica, y heces de vacuno y porcino destinados al consumo humano. Además, este estudio generará la primera base de datos genómicos de E. coli resistente a colistina aislados de mosca doméstica de Perú.

CARHUALLANQUI PEREZ ,ANDREA