Minería bioinformática para develar los mecanismos evolutivos de patogenicidad de Moniliophthora roreri y M. perniciosa, los patógenos fúngicos más destructivos del cultivo de cacao en el Perú

Introducción Perú es el segundo mayor productor de cacao orgánico y uno de los más importantes proveedores de cacao fino de aroma del mundo. Problema Las enfermedades más destructivas de cacao en Perú son la moniliasis y la escoba de bruja, las cuales pueden llegar a perder el 80% de la producción e incluso motivar el abandono de las parcelas. Estas enfermedades son causadas por los hongos Moniliophthora roreri y M. perniciosa, que pertenecen a la familia Marasmiaceae. Esta familia comprende hongos mayoritariamente descomponedores de materia orgánica, y se desconoce los mecanismos evolutivos que permitieron a M. roreri y M. perniciosa desarrollar patogenicidad en cacao. Método de Investigación Este proyecto incluye la realización de colectas de hongos Marasmiaceae en Amazonas, Cusco y Arequipa, la extracción de ADN para secuenciación genómica, y el trabajo bioinformático para ensamblar y anotar los genomas, y para identificar las familias o tipos de proteínas involucradas en patogenicidad de M. roreri y M. perniciosa. Hipótesis Moniliophthora roreri y M. perniciosa tienen un repertorio de genes y enzimas especializadas en la degradación de células vegetales que han evolucionado de manera selectiva, a diferencia de las especies Marasmiaceae descomponedores, causando que se conviertan en patógenos del cacao. Objetivo general El objetivo general de este proyecto es identificar los mecanismos de patogenicidad de M. roreri y M. perniciosa en cacao durante su evolución a través de un análisis bioinformático de genomas de especies en la familia Marasmiaceae. Objetivos específicos 1) Colectar especímenes de especies Marasmiaceae en Amazonas, Cusco y Arequipa; 2) Secuenciar y anotar genomas de especies Marasmiaceae colectadas; 3) Identificar los repertorios de proteínas efectoras y enzimas degradadoras de carbohidratos de los genomas obtenidos; 4) Identificar los mecanismos de evolución de patogenicidad en cacao de M. roreri y M. perniciosa. Resultado esperado Secuenciar el genoma de al menos 10 especies de hongos en la familia Marasmiaceae para y realizar una comparación bioinformática de los genomas para llegar a entender los mecanismos de patogenicidad de M. roreri y M. perniciosa en cacao. Impacto Esta propuesta sentará las bases de conocimiento para que en un futuro se desarrollen iniciativas tecnológicas con mucha aplicabilidad para controlar la moniliasis y la escoba de bruja del cacao, lo que a su vez beneficiará a los pequeños productores de cacao del Perú y Latinoamérica.